Lernzeiten können ein Instrument zur Etablierung von Chancengleichheit sein, wenn Lernangebote sich nicht an einem durchschnittlichen Leistungsniveau orientieren, sondern die unterschiedlichen Ausgangslagen, Neigungen und Bedarfe von Schülerinnen und Schülern berücksichtigen. 

Eine wissenschaftliche Expertenkommission hat - einberufen von der Vodafone-Stiftung - im Jahr 2013 Empfehlungen zusammengestellt, die auf Erkenntnissen der internationalen Forschung und wesentlich auf den von der U.S.-amerikanischen National Parent Teacher Association (PTA) entwickelten „Standards of Family-School Partnership“ gründen. 

Alle Klassenpflegschaftsvorsitzenden nehmen an der Sitzung der Schulpflegschaft teil, die in der Regel einmal im Schuljahr tagt. Die Schulpflegschaft vertritt die Interessen aller Eltern der Schule gegenüber der Schulleitung und den anderen Mitwirkungsgremien.

Lernzeiten müssen immer betreut stattfinden. Inwiefern Personal ergänzend zu Lehrkräften eingesetzt werden kann, ist von dem gewählten Lernzeitmodell und dessen rechtlichen und finanziellen Bedingungen abhängig. In Abhängigkeit zum gewählten Lernzeitmodell legen Schulen fest, welches Personal die Lernzeiten begleitet.

Welche Räume für Lernzeiten genutzt werden, hängt vor allem davon ab, welches Raumprinzip die Schule verfolgt. Hier werden grundsätzlich das "Klassenraumprinzip" und das "Lehrer/innen-Raumprinzip" unterschieden. Beim "Klassenraumprinzip" bleibt die Klasse in ihrem Klassenraum und arbeitet dort oder in den benachbarten Parallelklassen. 

Bei der Implementierung von Lernzeiten sind neben einer gemeinsamen pädagogischen Vorstellung organisatorische Aspekte zu beachten. Dabei stellen sich oft die Fragen, woher die Zeit für diese Stunden genommen wird und an welchen Stellen die Lernzeiten im Stundenplan verankert werden können.

Im Rahmen der Lernzeit erarbeiten sich Schülerinnen und Schüler u. a. Lerninhalte für den Fachunterricht. Sie lernen neue Inhalte und vertiefen bereits bekannte. Lernzeiten eignen sich besonders, um den unterschiedlichen Lernenden passgenaue Aufgaben und Lerngelegenheiten zur Verfügung zu stellen – nicht alle Schülerinnen und Schüler arbeiten gleich schnell, benötigen die gleichen Erklärungen oder haben die gleichen Interessen.

Im Fachunterricht stehen die Lehrerinnen und Lehrer vor der Herausforderung, die Inhalte und Ergebnisse der Lernzeit sinnvoll mit dem Fachunterricht zu verbinden. Bei der Entwicklung eines Konzeptes, das eine sinnvolle Verknüpfung anstrebt, können die folgenden Fragen hilfreich sein.

Kompetenzerwerb als zentrale Aufgabe des schulischen Lernens setzt voraus, dass Schülerinnen und Schüler selbst aktiv werden können – Kompetenzen werden eigenständig erworben statt in erster Linie gelehrt. Viele Schulen arbeiten deshalb mit Kompetenzrastern.

Sollen Arbeitsergebnisse in den Unterricht einfließen oder wollen Lehrerinnen und Lehrer sich einen Eindruck vom Kenntnisstand ihrer Schülerinnen und Schüler machen, so stellt sich den Lehrkräften zu Recht die Frage, wie die Kontrolle und Bewertung all dieser Arbeiten gestaltet werden kann, ohne dass ein Großteil der Unterrichtszeit dafür aufgewendet werden muss.